Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi Arkeoloji Bölümü 2011 yılında Prof. Dr. Turan Efe tarafından kurulmuş olup aynı yıl lisans düzeyinde eğitime başlamış ve ilk mezunlarını 2015 yılında vermiştir. Kurucu bölüm başkanımız Prof. Dr. Turan Efe 19.09.2016 tarihinde emekliye ayrılmıştır. Bölümümüzde 2012-2020 yılları arasında Eskişehir Anadolu Üniversitesi ile ortak Yüksek Lisans Programı sürdürülmüştür. 2020 yılından itibaren Bölümümüz, güz ve bahar dönemlerinde Protohistorya ve Önasya Arkeolojisi Yüksek Lisans Programına öğrenci kabul etmeye devam etmektedir. Halen bölüm akademik kadrosunda 2 Profesör (Erkan Fidan, Murat Türkteki), 3 Doçent ( Deniz Sarı, Sinem Türkteki, Hüseyin Erpehlivan) ve 1 Araştırma Görevlisi (Yusuf Tuna) yer almaktadır.  Ayrıca Bölümümüz öğretim elemanı Arş. Gör. Haralambos Nikolayidis 35. madde ile geçici olarak Mimar Sinan Üniversitesi’nde görevli olarak bulunmaktadır. Bölümümüzde Dr. Sevingül Bilgin 2014-2019 yılları arasında ve İnan Kopçuk ise 2014 yılında Araştırma Görevlisi olarak çalışmıştır.

Üniversitemiz Coğrafya Bölümü öğretim üyesi Doç. Dr. Levent Uncu’nun 2012 yılında Bölümümüzde verdiği derslerin yanında Doç. Dr. Michele Massa 2016-2018 yılları arasında sözleşmeli yabancı uyruklu öğretim elemanı olarak ve Dr. Sezer Seçer Fidan, 2013-2021 yılları arasında 2547 sayılı kanunun 31. maddesi uyarınca dersler vermiştir. Üniversitemiz Tarih Bölümü öğretim üyesi Doç. Dr. Gülgüney Masalcı Şahin 2021 yıllından bu yana Bölümümüzde dersler vermektedir.