Üniversitemiz 1989 yılında YÖK-DÜNYA BANKASI II. ENDÜSTRİYEL EĞİTİM PROJESİ kapsamına girerek oldukça donanımlı laboratuvarlara, akademik, teknik ve idari personele sahip olmuştur. Daha sonra Meslek Yüksekokulumuz 2007 yılında 5662 sayılı kanunla ve ek madde 81 ile ismi Meslek Yüksekokulu şeklinde değiştirilerek yeni kurulan Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi bünyesine katılmıştır.

Programımız, Otomotiv Programı olarak 1987 yılında Anadolu Üniversitesi Bilecik Meslek Yüksekokulu bünyesinde kurulmuştur. Anadolu Üniversitesi bünyesinde pek çok öğrenciyi yetiştirip, mezun ederek sektöre teknik eleman olarak kazandırmıştır. Program, daha sonra 2007 yılında kurulan Bilecik Üniversitesi bünyesine geçmiştir.